從解讀蛋白質宇宙到破解癌症祕密,化學家陳玉如的不設限人生(上):外行人一頭栽進生命科學核心
中央研究院第35屆院士名單揭曉,今年共選出19位新科院士、3位名譽院士,其中女性院士8人、名譽院士也全為女性,女性當選人數創歷年最多。《癌症問康健》曾專訪新科院士陳玉如,分享她一路從化學跨進生命科學,投入破解疾病祕密的研究旅程。
圖片來源 / 陳德信攝
在國際癌症領域,中央研究院化學研究所特聘研究員陳玉如之所以令人印象深刻,不僅因為她帶領臺灣癌症登月計畫團隊連續在《細胞(Cell)》、《癌細胞(Cancer Cell)》等頂尖期刊發表成果,更因為她十多年來勇敢「跨界」,跨專業、跨技術、跨疾病、跨團隊協作,每次轉身,都讓她成為連結基礎醫學、臨床和國際合作,提出癌症新診療方法的關鍵人物。【透視臺灣「癌症登月計畫」:改寫肺癌教科書、解密早期腫瘤隱藏的復發危機】
「Dr. Chen,你到底要幹嘛?」
陳玉如根本不是生物學背景出身,卻成了破解疾病祕密的專家,2008年擔任臺灣蛋白質體學會理事長,2019年更當選世界人類蛋白質體組織(HUPO)理事長,是HUPO史上最年輕和亞洲第一位女性領導者。
臺大化學系畢業後,她負笈美國愛荷華州立大學取得博士學位,接著到阿姆斯(Ames)國家實驗室工作,專長是設計先進質譜儀器。
質譜儀(Mass spectrometer)是一種為分子「秤重量」的機器,這門技術將樣品中的分子打碎、加上電荷,再送進儀器測量碎片的質量,不同分子有不同的質量數值組合,就像獨特的「指紋」,只要比對資料庫,就能明白樣品內化合物種類和數量。質譜儀是研究化學的強大工具,臨床檢驗、食品安全、檢測環境污染也都離不開它,應用領域相當廣,彷彿現代科學的多用途放大鏡。
1999年她返臺進入中研院化學研究所工作時,自然而然把同一套路線搬回來:「一開始其實沒打算做研究,我以為只要製作儀器、幫同事測合成化學分子的質譜就好。」但她發現,美國國家實驗室職位分工精細,而且上下游的機械、電子等加工設施一應俱全,因此她可以專職打造實驗儀器,化學所沒有這些條件,她全副心思擺在機器上,似乎走進了死胡同。
這樣團團轉忙了一兩年,直到某天化學所諮詢委員會上,清華大學廖俊臣榮譽教授開門見山問她:「Dr. Chen,你到底要幹嘛?」
一句不留情面的質疑,成了她跨界的第一個起點。
從零開始的勇氣,化學人硬闖生化領域
她意識到,要由「造機器」轉向「用質譜儀回答科學問題」,徬徨無計之時,她聽從同僚鄭建中博士(現為嘉義大學應用化學系教授)建議,轉向鑽研生物分子,問題是,「我從來沒上過生化課,連DNA、Protein(蛋白質)都聽不懂,」她笑說,「所以從頭學起,然後動手開始做。」
輕描淡寫一句話,實際上是「砍掉重練」的辛苦歷程。一開始她從DNA入手,磨練分析技術,慢慢有醫師找上她合作,以微定序(Minisequencing)搭配質譜法解讀地中海型貧血基因,「合作很愉快,不過一起發表了幾篇不錯的論文後,我感覺DNA好像技術成熟了,沒那麼有挑戰性,」磨拳擦掌之際,她聽到了「蛋白質體學」這名字。
蛋白質體學是研究生物體內的大量蛋白質何時表現、何時分解,以及彼此間如何互動的學問。
和解讀基因不一樣,基因可以比喻成「靜」的樓房藍圖,蛋白質則是「動」的工地現場,沒有圖樣固然蓋不了房子,但是生理機能取決於琳瑯滿目的蛋白質分子,就像蝌蚪和青蛙有一模一樣的基因,兩者卻截然不同。
陳玉如求教於中研院生物化學研究所研究員陳水田博士,他是臺灣蛋白質體學的先驅,指點她使用二維電泳來探索蛋白質謎團。
所謂的二維電泳,是利用每一種蛋白質所帶的電荷量和質量各不相同,因此在電場中「游動」的速度也有快有慢,這項技術能在一片平面凝膠上,將蛋白質混合物分離成許多個獨立的斑點,直到2000年代前半都還是蛋白質體學的標準技術。
陳玉如回想,「做一次實驗花3天,只能看到幾十個蛋白質,」但細胞內同一時間活動的蛋白質動輒以千百計,實在緩不濟急。她看到現行技術的限制,創新魂再次燃起。
這時以往累積的經驗派上用場,她帶進質譜技術,一步步研發出高靈敏度的獨家手法,進化到一次可以分析數千個蛋白質,不只速度加快許多倍,更重大的意義是,科學家眼光一下子放大,不侷限在一小點上鑽,而能拉高到用細胞視角來解答生物現象,在分子層次給生命本質帶來全新的理解。
這股「好有趣」、「下一刻會發現什麼新東西?」的振奮心情,貫串了陳玉如往後20年的研究之路。也是在此時,又一次生涯轉折降臨,推著她從鑽研細胞走入「疾病」的領域。
跨入疾病研究的第一站:破解多囊腎
2007年時,陳玉如實驗室分析蛋白質在國內已闖出一番名號,中研院分子生物研究所研究員李鴻與她合作,為自體顯性多囊性腎病(ADPKD,簡稱多囊腎)找解方。
ADPKD是腎臟最常見的一種遺傳性疾病,病人腎組織內會長出愈來愈多泡狀囊腫,最後可能導致腎衰竭。當時無藥可用,他們透過蛋白質體學方法,以小鼠為實驗對象,尋找能作為藥物標靶的蛋白質。
李鴻是國際知名的模式動物專家,最著名的成就包括打造出全世界第一隻脊髓肌肉萎縮症(SMA)模式小鼠,為各國後續的SMA研究鋪開一條坦途。
研究做到一半,一張和善圓臉、總是埋首研究的李鴻猝然病倒,「很難想像,(李教授)看起來很健康,一診斷就是肺癌末期,過農曆年前才見面,過完年就不再出現了。」陳玉如神情一暗,「他的學生來轉達:老師希望能『託孤』。」意思是,託她指導學生繼續把研究做完,順利畢業。
在這項研究中,陳玉如團隊開發出結合放射性同位素標記、液相層析和質譜法的新技術,成功攻克傳統上無法高效率地定量細胞膜蛋白質的難關;然而,另一座障礙還在後頭。
分析出樣本含有哪些蛋白質和數量變化雖是重要成果,她指出,如何把雜蕪的大批數據「串成一個故事」,也就是條理分明地闡述多個蛋白質如何組建出細胞功能或導致病變,更是決定研究平平無奇或出色的分水嶺。
「我們真的很幸運,」陳玉如說,那時知名醫學期刊《刺胳針(Lancet)》恰好刊登一份回顧ADPKD研究的綜合報告,羅列待解的幾個關鍵問題,而最讓她受用的,是一張描繪出腎細胞蛋白質發生一連串互動的圖解,但是確切完整的訊息路徑仍有待釐清,提供了他們「說故事」的線索。
她帶著兩邊實驗室學生做實驗、梳理結果,蠟燭兩頭燒,寫出論文,投稿到《分子與細胞蛋白質體學(Molecular & Cellular Proteomics)》。文章刊出後短短幾個月,李鴻於2009年辭世,正值46歲盛年。
研究發表後,立即登上Faculty of 1000 Biology(編按:可譯為「千人生物學院」,由分散各國的超過2000位生物學領域專家評選「最值得讀的論文」,定期更新於網站,幫助科學家掌握尖端研究和趨勢)推薦榜單,陳玉如團隊一炮而紅。
她甚至接到一封意想不到的電子郵件,發信人是腎研究領域名列前茅的《腎臟國際(Kidney International)》期刊主編,「他說讀了文章,覺得非常棒,認為這套蛋白質體學分析法非常有潛力,邀我做他們的編輯委員。」
陳玉如趕緊婉謝:「我嚇死了,回信說我只是從蛋白質體學切入,看到一些未來可能的發展,但我真的不懂腎臟,非常感謝他的賞識及鼓勵。」
雖然沒答應邀請,但這封信對她意義非凡,她說:「給我的鼓勵太大了。」讓她確認團隊手中的嶄新方法具有前瞻性,也對研究繼續開枝散葉更有信心。
接下來,陳玉如為了病人,鼓起勇氣踏進癌症研究現場,動人故事請點我,繼續看下去
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