為讓台灣病友更快被精準診斷、取得新藥,國家級人體生物資料平台上路
近 20 年來,全球多國紛紛建置龐大的儲存庫,經民眾同意後蒐集醫療健康數據和血液等檢體,也進行基因檢測,以基因資料作為該國研發新的疾病診斷法、新藥,或是預測罹病風險因子的基礎。台灣正急起直追。
圖片來源 / 國家級人體生物資料庫整合平台提供
一個知名的實例是 2006 年啟動的英國生物資料庫(UK BioBank),公部門與藥廠等企業合作,蒐集 50 萬人的檢體和健康紀錄,並做完DNA檢測。這些巨量又脈絡分明的資料,可以供學術單位、政府和民間企業來申請使用,開啟了成功的「公私合作聯盟模式」。
台灣的足跡和其他先行國家不盡相同,2010 年通過《人體生物資料管理條例》後,國內大醫院及一些研究機構相繼設立生物資料庫。然而,單一醫院的收案量不大,而且多半優先給院內醫師和研究人員使用,因此使用率偏低。
再者,以研發一種新的大腸癌診斷法為例,需要取得相當數量的檢體作基礎,才能兼顧準確和實用性,但單一家機構的大腸癌病例或許只佔總量的寥寥幾個百分點,換句話說,研發者必須跑好幾家醫院才能蒐集到足夠的檢體,現實上窒礙難行,對於發展精準醫療(註)來說,無疑非常不利。【推薦閱讀:精準醫療再進步!體液NGS基因檢測通過LDTs核准,準確度、可靠性更高】
一站式服務,降低研發門檻
如果從國家層級角度思考,加上對照國外經驗,何不把「必須跑好幾家醫院」的障礙清除?產醫學研界只要透過單一窗口,就能申請取得足夠的檢體和其他必要資訊,大大降低醫療研發門檻。
為了串起散落各地的資料庫,提升使用效率,凝聚力量打「團體戰」,由國家衛生研究院主導的「國家級人體生物資料庫整合平台(National Biobank Consortium of Taiwan,以下簡稱NBCT)」在2019年應運而生。
國衛院院長司徒惠康接受媒體採訪時言簡意賅點出特色:有單一窗口、一致的流程,還有加值服務,以NBCT串接台灣各地的人體生物資料庫。
簡單來說,NBCT提供一站式服務,將全國人體生物資料庫連結成一體,並且訂定一致的品質標準和臨床資料內容,除了提供各種疾病的檢體和臨床數據,也為個別疾病建立基因資料庫。
國衛院分子與基因醫學研究所研究員級主治醫師黃秀芬,2019 年時受院方委託,接下NBCT首任執行長的重任。
她本身是資深病理科醫師,深諳醫療機構和人體生物資料庫的運作模式,截至 2024 年 9 月,黃秀芬跑遍全台,已邀集 37 家醫院及公私機構加入NBCT,包括台大醫院、台北榮民總醫院、林口長庚紀念醫院等大型醫院,以及中央研究院、台灣腦庫等研究機構。【推薦閱讀:每位癌症病人都獨一無二!有智慧醫療,才做得到精準治癌】
NBCT目前涵蓋 101.9 萬筆病人檢體及醫療資訊,其中腫瘤收案佔 17.2 萬例,非腫瘤疾病佔 84.7 萬例。
黃秀芬曾透露,有一位開發慢性腎臟病檢測新法的業者,向NBCT申請檢體,5 個月內就取得 5 家醫院提供的 200 份檢體,如果各別向醫院申請,可能得花上好幾年,因此業者感到很滿意。
打破機構長年的藩籬絕非易事,不過一向對外低調的她,只簡潔地表示:「既然接下責任,那就是使命必達。」總結箇中種種甘苦。
資料互通、去識別化,兼顧便利和隱私
說服醫院點頭加入是一回事,要讓資料能夠互通,還需要下一番苦工。
不同醫療機構收儲病人治療歷程的資料格式各有差異,要用於研發新科技前,必須先經過處理,彼此之間才能互通。
國內醫療院所早先已經有建置電子病歷及健康紀錄系統,NBCT團隊借力使力,為此擬定一套做法,提供醫療機構轉檔和分析的電腦程式工具,在既有的電子資料架構下建立「共同資料模式(common data model)」,設定標準化的欄位,裡頭包含病人疾病診斷、治療和追蹤的資訊。
這些標準化的資料,都不會離開原機構。在申請人的計畫書經審核通過後,各合作單位再依照一致的設定格式,從庫藏中提取出資訊,交給NBCT,NBCT彙整後,經過二次加密,再提供給申請者。
所有生物資料離開合作單位前,也必須按照《人體生物資料庫管理條例》中的資訊安全管理辦法,將可能辨認出病人身分的訊息清除乾淨,這過程稱為「去識別化」。每件病人檢體出庫時也一樣,連檢體來自哪家醫院都無法得知,因此不論申請者是產業或研究單位,皆無法辨別出病人身分。【推薦閱讀:全球治癌新趨勢》多專科+分子醫學,照亮最佳治癌路徑】
同時,為了更細膩保護病人隱私,NBCT提供的生物資料僅限於申請書中列明的「對該研究不可或缺的項目」,其他非必須資訊一律不提供。
為提升癌友治療效果與生活品質 「國家隊」努力起跑
黃秀芬強調,NBCT的理念是友善且安全地協助產醫學研各界,能合法使用高品質的檢體和醫療數據,成為發展生技醫藥和健康照護產業的重要資源。
她也指出,在符合《人體生物資料庫管理條例》的規範下,整合式平台服務可以推動精準醫療進展,特別是和基因有密切關聯的癌症,能夠實質提升癌友的治療效果及生活品質。
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